象徵著神奧地區的3座湖 「心齊湖」、「立志湖」、「睿智湖」是3座水源豐沛的湖。據說這幾座湖底下有傳說的寶可夢沉睡著。 傳說的寶可夢「由克希」、「艾姆利多」、「亞克諾姆」 牠們是出現在神奧地區所流傳的神話裡的3隻傳說的寶可夢。當地居民稱「由克希」為知識之神，稱「艾姆利多」為感情之神，稱「亞克諾姆」為意志之神。這3隻寶可夢究竟會如何影響故事的發展呢？
