《寶可夢傳說 阿爾宙斯》正式可以開始玩了，一樣來做一些故事劇情跟攻略。
首先一開始是主角從空中掉下來，本來以為這部的主角是小光他們的祖先，沒想到原來是小光本人啊，而且就 NPC 對話得知這時的小光已經 15 歲了，比原本的鑽石/珍珠的設定又大了幾歲。
故事開始遇到拉苯博士，會跟你敘述目前世界的設定。
接著會帶你到祝慶村替你安排居住的地方。
之後就是加入銀河隊的劇情，會要你從火球鼠、木木梟與水水獺挑選一隻當初始的夥伴。
要離開村莊會遇到望羅，進行第一次的寶可夢對戰，在這個時代寶可夢對戰還不是很盛行。
移動到黑曜原野，這邊會要你捕捉三隻寶可夢，三隻分別是會呆呆給你抓的大牙貍，一受驚嚇就會跑掉的姆克兒還有會攻擊你的小貓怪，會教你該怎麼應付這三種狀況的寶可夢捕捉。
完成第一個任務後也能獲得制服，換上後就正式成為銀河隊的一員了。
